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能量代謝的重編程是由基因組不穩定引起的腫瘤的1個(gè)標志。在腫瘤進(jìn)展中廣泛存在的代謝紊亂為癌細胞的生長(cháng)和分裂提供了必要的來(lái)源。與正常成人組織相比，腫瘤內的碳水化合物、脂質(zhì)和氨基酸代謝可能發(fā)生顯著(zhù)的轉化變化(圖1)。*的癌癥相關(guān)的代謝變化包括:葡萄糖和氨基酸攝取失調、利用營(yíng)養獲取的機會(huì )模式、利用糖酵解/三羧酸循環(huán)(TCA)、用于生物合成和NADPH生產(chǎn)的循環(huán)中間體，以及對氮需求的增加。研究腫瘤異常代謝的機制對制定有效的腫瘤治療策略具有重要意義。這些能量代謝的重新定向是由蛋白質(zhì)和非編...
1從培養的CCLE細胞系中提取代謝產(chǎn)物體外培養20種主要癌癥類(lèi)型的928個(gè)癌細胞系，用于124種極性代謝物和101種脂類(lèi)的代謝組學(xué)分析(圖1a)。使用層次聚類(lèi)來(lái)評估細胞系之間的代謝相似性。兩個(gè)主要的聚類(lèi)與造血系和非造血系有很強的相關(guān)性，表明這兩組的主要代謝是有差異的(p確切檢驗)。為了進(jìn)一步量化代謝物水平(y)與主要癌癥譜系(X)的關(guān)系程度，采用線(xiàn)性回歸模型進(jìn)行分析。結果表明，225個(gè)代謝物中有148個(gè)的譜系效應(定義為r2)大于0.1，表明這些代謝物中至少有10%的跨細胞系...
大家在讀醫學(xué)研究文獻時(shí)常常會(huì )看到1種不明覺(jué)厲的研究技術(shù)，叫“Acyl-biotinylExchange”，12271228翻譯過(guò)來(lái)就是“?；?生物素交換法”。這種方法主要用于研究蛋白質(zhì)所發(fā)生的翻譯后修飾。大多數蛋白分子都有多個(gè)不同的翻譯后修飾機制，用以調節蛋白功能。蛋白質(zhì)zui常見(jiàn)的翻譯后修飾方式叫磷酸化，主要發(fā)生在絲氨酸、蘇氨酸等殘基位點(diǎn)上，常常通過(guò)特異性的抗體進(jìn)行檢測。除了磷酸化之外，蛋白質(zhì)的翻譯后修飾的方式還有很多，例如糖基化、乙?；?、甲基化、亞硝基化、谷胱甘肽化、棕櫚...
Blast（BasicLocalAlignmentSearchTool），可謂生信領(lǐng)域zui常用的工具，拿到1段序列（測序結果，或設計好的引物等等），1般都會(huì )去blast1下，查找相似序列。在查找相似序列的基礎上衍生出了各種作用，比如鑒別基因組，蛋白質(zhì)，查找特定靶區，檢驗引物特異性等等。自打1990年由AltschulSF等人開(kāi)發(fā)出來(lái)，NCBI引進(jìn)，至今還在改善，更新算法。量身選用數據庫做BLAST不僅要考慮選擇哪種算法，還要考慮選哪個(gè)數據庫來(lái)比對。我們zui常用的可能就人1...
當我們資源不足時(shí)，自然會(huì )想要找一些省錢(qián)的辦法來(lái)發(fā)文章，窮則思變嘛。生信是個(gè)好辦法，可是有些醫生朋友還是覺(jué)得不太熟悉，別說(shuō)后邊的分析方法了，就連開(kāi)始找數據都不好找。研究腫瘤的比較有福，腫瘤的數據zui豐富了，像大名鼎鼎的TCGA、Ocomine等?？裳芯科渌膊〉脑趺崔k，有沒(méi)有疾病特異性數據庫呢？資源上哪找隨著(zhù)研究成果的積累，大大小小的數據庫們就冒了出來(lái)，駐扎在互聯(lián)網(wǎng)的各個(gè)角落，現在已1218經(jīng)有了上千個(gè)。找數據比較權wei的資源集中站，是牛津大學(xué)出版社的NucleicAcid...
腫瘤細胞構建的大問(wèn)題在于腫瘤微環(huán)境的復雜性，人類(lèi)的機體并不像培養皿（瓶）般是塑料的。而且隨著(zhù)癌癥的復雜性被越來(lái)越多的研究揭露出來(lái)，腫瘤組織不僅僅是由腫瘤細胞所1214組成的觀(guān)點(diǎn)已經(jīng)成為普遍共識，因而，許多研究人員都認為是時(shí)候升級他們在實(shí)驗室中構建腫瘤模型的方法及技術(shù)了。腫瘤模型構建的瓶頸腫瘤細胞構建的大問(wèn)題在于腫瘤微環(huán)境的復雜性，人類(lèi)的機體并不像培養皿（瓶）般是塑料的。而且隨著(zhù)癌癥的復雜性被越來(lái)越多的研究揭露出來(lái)，腫瘤組織不僅僅是由腫瘤細胞所組成的觀(guān)點(diǎn)已經(jīng)成為普遍共識，因而，...
利用實(shí)驗動(dòng)物進(jìn)行整體水平的腫瘤研究，是基礎研究中的重要組成，可以說(shuō)是高分文章*之選。翠花這里給大家匯總了常用的腫瘤動(dòng)物模型，歡迎收藏！1、自發(fā)瘤模型：實(shí)驗動(dòng)物未經(jīng)任何有意識的人工處理，自然發(fā)生腫瘤1208優(yōu)點(diǎn)：①近似人類(lèi)腫瘤發(fā)生過(guò)程，實(shí)驗結果更易于外推到人；②相比移植瘤，對藥物的敏感度不高，療程長(cháng)，便于進(jìn)行綜合治療；③可觀(guān)察遺傳因素在腫瘤發(fā)生上的作用。1209缺點(diǎn)：①個(gè)體之間生長(cháng)速度差異較大，腫瘤發(fā)生發(fā)展參差不齊，很難在限定時(shí)間內獲得大量生長(cháng)均勻的荷瘤動(dòng)物；②試驗周期長(cháng)；③需...
腫瘤細胞構建的zui大問(wèn)題在于腫瘤微環(huán)境的復雜性，人類(lèi)的機體并不像培養皿（瓶）般是塑料的。而且隨著(zhù)癌癥的復雜性被越來(lái)越多的研究揭露出來(lái)，腫瘤組織不僅僅是由腫瘤細胞所1214組成的觀(guān)點(diǎn)已經(jīng)成為普遍共識，因而，許多研究人員都認為是時(shí)候升級他們在實(shí)驗室中構建腫瘤模型的方法及技術(shù)了。腫瘤模型構建的瓶頸腫瘤細胞構建的zui大問(wèn)題在于腫瘤微環(huán)境的復雜性，人類(lèi)的機體并不像培養皿（瓶）般是塑料的。而且隨著(zhù)癌癥的復雜性被越來(lái)越多的研究揭露出來(lái)，腫瘤組織不僅僅是由腫瘤細胞所組成的觀(guān)點(diǎn)已經(jīng)成為普遍...
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